分类: R语言教程
基因相关性圈图(Circos图)
1.图片特点
这是一幅基因相关性圈图,通常被称为 Circos 图,它用于可视化多个基因之间的相关性关系。包括以下结构:
外围环:每个外部的长方形块代表一个基……
孟德尔随机化报错:Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL)
在线从 GWAS 数据库提取数据是比较常见的做法,不过最近小伙伴可能发现在提取数据时候会出现这样的错误Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL) ,排除网络……
基础图片复现:分组散点箱线图+显著性
代码主要完成的功能如下:
读取两个CSV文件(sh1.csv 和 sh2.csv)sh2_modified sh1_modified。
使用tidyr包将宽数据转换为长数据。
增加一个分组列。
删除包……
SCI图片复现:面积图
省流:完整代码拉到最后
首先数据表格要求:
1. 趋势气泡图数据:这个数据应该是一个CSV文件,具有三个列。第一列应该是"Diameter",代表直径,应该是……
NC图片复现:多组学散点图(象限)
采用的是MASS包中的mvrnorm函数生成二元正态分布的数据,数据的列名分别为"mRNA_FC"和"RPF_FC"。
完整代码:
# 加载必要的库
library(MASS)
library(ggplot2)……
SCI图片复现:GO柱状图-不同色彩分组
我们需要一个CSV文件,其中至少包含三列数据:'Description','Count' 和 'Cluster'。'Description' 是对项目的描述,'Count' 是相应的计数,'Cluster' 是用来……
nature communications图片复现散点小提琴图+蜜蜂图
对读取的数据进行一些统计分析,并创建一个包含violin图、点分布、平均值线和误差线的ggplot2图表。
假设数据包括两个主要列: "Treatment" 和 "Integrated.den……
SCI图片复现:批量散点柱状图
代码是做一系列的基因表达量的箱线图并进行了分组的t检验。需要两个CSV文件,一个是 "Exp.csv",它应该包含表达量数据,另一个是 "info.csv",它应该包含样本……