R语言教程

孟德尔随机化报错：Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL)
在线从 GWAS 数据库提取数据是比较常见的做法，不过最近小伙伴可能发现在提取数据时候会出现这样的错误Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL)  ，排除网络……
3D饼图
饼图是一种常见的数据可视化图表，适用于展示数据的分布情况，尤其是用于比较各部分与整体的关系。本文展示使用plotrix包中的pie3D函数绘制3D饼图。 生成模拟……
SCI图片复现：热图+柱状图
创建一个包含5种肿瘤类型（A, B, C, D, E）和10个基因（Gene1到Gene10）的数据集，每个基因在每种肿瘤类型中的出现频率是随机生成的 library(xlsx) library(C……
SCI图片复现：复杂热图+连接线
复杂热图+连接线 使用patchwork和ggplotify库将两个热图和基因连线图进行拼接。layout变量定义了每个子图的位置。最后，使用print()函数显示最终图形，使用ggs……
SCI图片复现：复杂热图
从头到尾的完整代码，包括生成示例数据、处理数据、绘制热图及相关注释、绘制柱状图以及保存为 PDF 文件：根据自己数据调整 # 生成数据矩阵 LU_matrix <- ……
SCI图片复现：渐变火山图
# 加载包： library(ggplot2) # 创建示例数据集： set.seed(42) # 为了保持随机生成的结果一致性 sample_size <- 5000 data <- data.frame(log2F……
高分SCI图片复现：箱线图+散点图
使用示例数据进行，请根据实际需要调整 # 创建虚拟数据： Bacteroides_A <- runif(50, min = -17, max = -12) Bacteroides_B <- runif(50……
R语言进阶绘图：三维PCA
三维主成分分析（3D PCA）是一种统计方法，用于降低高维数据的复杂性，同时保留数据中的大部分变异。通过对原始数据进行线性变换，PCA提取出主成分，这些主成……
R语言进阶绘图：PCA
主成分分析（PCA）是一种降维技术，用于在数据中发现潜在的模式，降低数据的复杂性，同时尽可能地保留原始数据的信息。PCA通过找到数据中方差最大的正交（垂直……
R语言进阶绘图：火山图
常规火山图 下面的示例中，我将创建一个虚构的数据集，展示前几行，并绘制一张美观、详尽的火山图。我们将使用ggplot2包创建火山图。请注意，这个示例使……
R语言进阶绘图：生存曲线
两组间带置信区间的生存曲线 以下是一个使用R语言和survival及ggplot2包绘制两组间带置信区间的生存曲线的示例。我们将使用lung数据集，该数据集包含了……
R语言基础统计示例：标准分布
R语言提供了许多用于处理概率分布的函数，其中标准分布（如正态分布、卡方分布、t分布和F分布等）尤为常用。以下是关于R语言中标准分布的详解和应用实例……
R语言基础统计示例：逻辑回归
逻辑回归是一种广泛应用的统计学方法，主要用于预测分类变量（如二分类或多分类）。以下是关于R语言中逻辑回归的详细解释及应用实例。 逻辑回归的原理 逻……
R语言基础统计示例:多重线性回归
多重线性回归是一种统计方法，用于探究多个自变量与因变量之间的关系。在R语言中，可以使用lm()函数进行多重线性回归分析。以下是一个详细的解释和应用实例： ……
chatGPT简单开始
来看看来自chatGPT的自述 再看看功能界面：已支持4.0模式 废话不多说，大家先自个体验一波。 安卓版：AIChat中文，快点使用你的专属人工智能吧。下载地址：h……
R语言统计分析一览
R语言是统计分析的强大工具，提供了丰富的统计函数和方法。以下是R语言统计分析的详解及应用实例： 描述性统计分析： # 创建一个数值向量 data <- c(12……
R语言基础数学运算
在R语言中，可以进行各种基本数学运算，包括加法、减法、乘法、除法、指数运算等。以下是关于R语言基础运算的详解和应用实例： 加法、减法、乘法和除法： ……
R语言基础绘图：饼状图
饼状图是一种可视化工具，用于显示类别变量的相对比例。在R语言中，可以使用ggplot2包创建饼状图。以下是饼状图的详解和应用实例： 安装并加载ggplot2包： ……
R语言基础绘图：折线图
折线图是一种常见的数据可视化方法，用于显示数据随时间或其他连续变量的变化。在生物信息学中，折线图可以用来展示基因表达随时间的变化、生物过程的动……
R语言基础绘图：散点图
首先，散点图是一种常用的数据可视化方法，用于显示两个变量之间的关系。在散点图中，每个观察点都用一个点表示，一个轴表示一个变量。如果两个变量之间存在某……
R语言基础绘图：直方图
如何创建和自定义直方图。请按照以下步骤操作： 安装和加载所需的包： 要创建直方图，我们需要使用ggplot2包。如果您尚未安装，请使用以下命令安装： ……
R语言基础绘图：箱线图
箱线图（Boxplot）是一种展示数据分布特征的图形工具，能够直观地显示数据的中位数、上下四分位数、最大值、最小值以及异常值。在R语言中，我们可以……
R语言基本绘图：直方图
在R语言中，可以使用ggplot2包轻松创建条形图。条形图是一种可视化数据的有效方法，可以显示各类别的数值大小。下面是如何使用R语言创建条形图的详解和一个简……
json文件详解及应用实例
R语言中可以使用jsonlite包来处理JSON文件。jsonlite包提供了一系列函数，用于读取、解析、操作和写入JSON文件。首先，确保已经安装了jsonlite包。如果没有安……
数据帧（补充）
数据帧（data frame）是R语言中非常重要且常用的数据结构。数据帧类似于一个二维表格，其中每列可以包含不同类型的数据（如数值、字符或因子），每行代……
XML文件详解及应用实例
R语言中可以使用XML包来处理XML文件。XML包提供了一系列函数，用于读取、解析、操作和写入XML文件。首先，确保已经安装了XML包。如果没有安装……
二进制文件详解及应用实例
在R中，二进制文件指的是以二进制格式存储数据的文件。二进制文件可以有效地减小文件体积并提高数据读写速度。在本文中，我们将详细解释R语言的二进制文……
R语言中excel文件使用详解及应用实例
在 R 语言中，处理 Excel 文件主要涉及到读取、写入和操作数据。以下是使用 R 语言处理 Excel 文件的详解和应用实例。 安装和加载所需的包： 首先，确保安装并……
R语言中CSV文件使用详解及应用实例
R语言是一种用于数据分析和统计建模的编程语言，支持读取和处理各种类型的数据文件，包括CSV文件。CSV（Comma Separated Values）是一种通用的文本文件……
字符串详解及应用实例
在R语言中，字符串是一种非常重要的数据类型。字符串可以用来表示文本、标签、文件名等，其处理和操作也非常灵活。下面是R语言字符串的教程及应用实例。 字符……
循环详解及应用举例
R语言中有很多种循环语句，包括for循环、while循环、repeat循环等。这些循环语句可以帮助我们在程序中多次执行同一段代码，以实现一些重复性的任务。以下是一……
数据框详解及应用举例
R语言中的数据框（data.frame）是一种非常重要的数据结构，它类似于Excel表格，是存储数据的基本单位。数据框可以用来存储二维数据，每一列可以有不同的数据类……
因子详解及应用举例
R语言中的因子是一种数据类型，用于表示分类变量。在统计分析中，分类变量通常是指离散的，有限的取值集合，例如性别（男/女）、教育程度（高中/本科/硕士/博……
数组详解及应用举例
在R语言中，数组(array)是一种多维数据结构，它可以包含相同类型的数据元素。R语言中的数组可以是二维、三维或更高维的数据结构。在R语言中，可以使用函数arra……
矩阵详解及应用举例
R语言中的矩阵(matrix)是一个二维的数据结构，其中的元素必须是相同的数据类型。矩阵中的元素可以通过行号和列号来访问，类似于二维数组。在R语言中，矩阵可以……
向量详解及应用举例
向量是最基本也是最重要的数据结构之一。向量是R语言中最基本的数据类型，它是一组相同数据类型的元素的有序集合。R语言中的向量可以包含数字、字符、逻辑值等……
R_常用数据类型
常用的数据类型 数值型（Numeric）： 包括所有实数，可以使用 as.numeric() 或 as.double() 函数将其他类型转换为数值型。 a <- 3 b <- 2.5 c <- a……
R_简单运算与逻辑
数学运算符 运算顺序 1  2  3  4  5  6  7  8 符号 () ^ %% %/% * / + - 含义 括号 乘方运算 整除求余 整除 乘法 除法 加法 减法 数学函数 函数 ……
R语言基础知识速览
基本语法 进入交互式编程窗口 R 工作目录 getwd() : 获取当前工作目录 setwd() : 设置当前工作目录 实例 # 当前工作目录 getwd() # 设置当前工作目录……
新人R语言基础知识速览
R语言基础知识速览 注意，本教程默认Windows 64位运行环境。 软件安装及运行环境配置 R软件下载及安装 官网下载：Download R- for Windows.点击进入链……