细胞毒实验:药物梯度设置和药物配比计算
认识单位
体积摩尔浓度(即物质的量浓度)可简写为 M ,表示mol/L
nM (nmol/L)
μM (μmol/L)
mM (mmol/L)
M (mol/L)
实验准备
查文献:药物IC50值(如10μM)
设置浓度梯度
药物的浓度(终浓度)一般应在nM~μM级,而母液常规是10~30 mM(in DMSO)
药物浓度梯度点为6~10个为宜(包含0浓度);
过少:可能绘制不出好的线
过多:96孔板不宜安排排布, 配药加药容易出错。
常见浓度梯:2、3、5、或10,以3为最常用
2倍:
0, 0.1, 0.2, 0.4, 0.8, 1.6, 3.2, 6.4 μM;
0, 1, 2.5, 5, 10, 25, 50, 100, 250 nM;
3倍:
0, 0.3, 1, 3, 10, 30, 100, 300, 1000 nM;
5倍:
0, 1.6, 8, 40, 200, 1000, 5000 nM;
10倍:
0, 0.004, 0.04, 0.4, 4, 40, 400 μM;
实验设计建议:做两轮梯度实验,第一轮粗,第二轮细。
第一轮低点要在最低参考IC50的1/50以下,高点至少要在最高参考IC50的50倍以上。
第二轮等比数列可以缩小一级,或者在第一轮的IC50区间增加密度,但注意第二轮不能太细,或者区间太窄。
药物配比(96孔板)
已知条件
应用液:1nmol/μL=1mM
相关文献显示在细胞中IC50为10μM
96孔板
重复6复孔
6个梯度
实验准备
浓度梯度分组:0μM 2.5μM 5μM 10μM 20μM 40μM
物品准备:配制好的药物、96孔板培养的已贴壁细胞、移液枪、配对枪头、培养基等
计算配药
设定
每孔中已含有100ul 10%FBS培养基
每孔中加入100ul药物溶液
倍比稀释
孔 | |
40μM | 100μl原培养液+100μl80μM药物溶液=200μl40μM |
20μM | 100μl原培养液+100μl40μM药物溶液=200μl20μM |
10μM | 100μl原培养液+100μl20μM药物溶液=200μl10μM |
5μM | 100μl原培养液+100μl10μM药物溶液=200μl5μM |
2.5μM | 100μl原培养液+100μl5μM药物溶液=200μl2.5μM |
0μM | 200μl培养液=200μl0μM |
应用液浓度:1mM
运算:1mM=1000μM;1000μM/80μM=12.5倍
即:将应用液稀释12.5倍
配制最大药物浓度两倍的浓度:80μM
取96μL的药物应用液,加上1104μL的无血清培养基,即将96μL的药物应用液稀释12.5倍,至终体积为1.2mL,即配制出了1200μL的80μM的药品。
40μM:每孔加入100μL的80μM的药品,6个复孔共600μL液体
补入600μL无血清培养基并吹匀,即将剩余药品浓度减半为40μM
20μM:每孔加入100μL的40μM的药品,6个复孔共600μL液体
补入600μL无血清培养基并吹匀,即将剩余药品浓度减半为20μM
10μM:每孔加入100μL的20μM的药品,6个复孔共600μL液体
补入600μL无血清培养基并吹匀,即将剩余药品浓度减半为10μM
5μM:每孔加入100μL的10μM的药品,6个复孔共600μL液体
补入600μL无血清培养基并吹匀,即将剩余药品浓度减半为5μM
2.5μM:每孔加入100μL的5μM的药品
完成加药并孵育到设定时间。