孟德尔随机化报错：Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL)

在线从 GWAS 数据库提取数据是比较常见的做法，不过最近小伙伴可能发现在提取数据时候会出现这样的错误Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL)  ，排除网络，服务器崩溃等原因，那就可能是2024 年 5 之后都需要设置 token 才可以继续访问服务器了，那应该如何解决呢。

问题所在

查询（https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR/issues/448）发现从 2024 年 5 之后都需要设置 token 才可以继续访问服务器。那如果咱们还没有设置过 token ，尝试使用下面的方法进行，官网解决方案：https://mrcieu.github.io/ieugwasr/articles/guide.html。

具体解决方案

官方解决方案翻译过来就是：

1. 登录 https://api.opengwas.io/profile/
2. 生成一个新令牌
3. 将 <token> 添加到您的 .Renviron 文件中。此文件可以在您的主目录中，也可以在您的 R 会话的工作目录中。您可以通过在 R 中运行 Sys.getenv("R_ENVIRON_USER") 来检查 .Renviron 文件的位置。
4. 重启您的 R 会话
5. 要检查您的令牌是否被识别，请运行 ieugwasr::get_opengwas_jwt()。如果返回一个长的随机字符串，则表示您已通过身份验证。
6. 要检查您的令牌是否正常工作，请运行 user()。它将使用您的令牌向 API 发出请求以获取您的用户信息。它应该返回一个包含您的用户信息的列表。如果返回错误，则表示您的令牌无法正常工作。

至于登录获得API，这个简单，不多赘述，点击：https://api.opengwas.io/profile/进入后登录，然后在

该位置申请即可，因为我已经申请过了，所以这里存在API，注意，这个是有14天时效的。

很多人会卡在具体如何设置的问题上，首先找到.Renviron，怎么找运行Sys.getenv("R_ENVIRON_USER") 或者Sys.getenv("R_USER") 来获取文件位置，然后右键使用文本文档编辑，输入OPENGWAS_JWT=API值 ，重启R会话框，ieugwasr::get_opengwas_jwt() 检查是否配置成功，再次运行读取提取数据代码，嗯，大功告成。